Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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H2-M10.4Q85ZW8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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