Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms