Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms