Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc29Q80VM3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ttc29Q80VM3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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