Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms