Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms