Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Dsg1bQ7TSF1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Dsg1bQ7TSF1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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