Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms