Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms