Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp3Q7TNH6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms