Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Shq1Q7TMX5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Shq1Q7TMX5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms