Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Trappc6aQ78XR0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Trappc6aQ78XR0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6aQ78XR0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Trappc6aQ78XR0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trappc6aQ78XR0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trappc6aQ78XR0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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