Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms