Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms