Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms