Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms