Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn2Q6PHP6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms