Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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