Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms