Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms