Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms