Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms