Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Smchd1Q6P5D8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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