Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms