Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms