Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc3bQ6NWW9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms