Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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