Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms