Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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