Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms