Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6GQU0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6GQU0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6GQU0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6GQU0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6GQU0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6GQU0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms