Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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