Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc5lQ6A068 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc5lQ6A068 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms