Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170Q6A065 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms