Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms