Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpgs2Q66JT5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpgs2Q66JT5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpgs2Q66JT5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpgs2Q66JT5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpgs2Q66JT5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpgs2Q66JT5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpgs2Q66JT5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpgs2Q66JT5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms