Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VclQ64727 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VclQ64727 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VclQ64727 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VclQ64727 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VclQ64727 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VclQ64727 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VclQ64727 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VclQ64727 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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VclQ64727 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VclQ64727 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VclQ64727 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VclQ64727 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VclQ64727 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VclQ64727 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VclQ64727 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VclQ64727 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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