Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn3Q64691 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms