Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms