Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja3Q64448 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms