Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms