Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifit1Q64282 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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