Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms