Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms