Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Supt6hQ62383 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Supt6hQ62383 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms