Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms