Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sall3Q62255 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms