Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six3Q62233 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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