Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttf1Q62187 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms