Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rbm38Q62176 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rbm38Q62176 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rbm38Q62176 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms